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生命科学学院韩管助课题组在逆转录病毒起源研究中取得重要进展

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最近,微生物学著名异物mBio(导致指数7.867)以“A missing link between retrotransposons and retroviruses”为题网上撤稿了常州师大时韩管外教教课题组有关逆袭录蠕虫病毒发源和发展的新研究探讨现况。

逆转录类病毒是复制过程需要逆转录的病毒总称,包括许多重要的动植物病原,如人类免疫缺陷病毒、乙肝病毒、花椰菜花叶病毒等。国际病毒分类委员会将逆转录类病毒统一为一个病毒界,即逆转录类病毒界(Pararnavirae)。逆转录类病毒目前可分为6个科:逆转录病毒科(Retroviridae)、花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)、宏病毒科(Metaviridae,即Ty3/Gypsy反转座元件)、假病毒科(Pseudoviridae,即Ty1/Copia反转座元件)、百保病毒科(Belpaoviridae,即Bel/Pao反转座元件)和嗜肝病毒科(Hepadnaviridae)。值得(de)注意的(de)是(shi)Ty3/Gypsy、Ty1/Copia和Bel/Pao反转座元件༒能够(gou)编码病毒外壳(qiao)蛋(dan)白(bai),因此它们一般也被认为是(shi)病毒。

近些年应该会认为瓦解录病原体是什么还可以来原于某个Ty3/Gypsy变换座开关元器件封装,如果己知的Ty3/Gypsy只字不提瓦解录病原体是什么亲缘社会关系距离远。同时还,瓦解录病原体是什么和乃至绝大多数Ty3/Gypsy变换座开关元器件封装有两种的不同事例:(1)瓦解录病原体是什么整合酶核淀粉酶可辨别的码某个双核酸酶H空间设计域;(2)瓦解录病原体是什么可辨别的码某个被膜核淀粉酶。韩管助研究组事先在脊梁骨哺乳动物表观遗传组中察觉一个多类新的瓦解录类病原体是什么——洛基瓦解录病原体是什么(lokiretrovirus)(Molecular Biology and Evolution 38:1031-1039)。洛基瓦解录病原体是什么表观遗传组辨别的码双核酸酶H空间设计域和被膜核淀粉酶,如果其被膜核淀粉酶和负义单链RNA病原体是什么(之所以瓦解录病原体是什么)含有还可以辨别的的同源性,洛基瓦解录病原体是什么的察觉为瓦解录病原体是什么较为复杂的繁衍打造了新的角度。

韩管助课题组在腔肠动物基因组中发现了一类新的反转座元件,将其命名为奥丁反转座元件(Odin retrotransposon)。奥丁反转座元件表现了独特的基因组结构特征:其和逆转录病毒类似能够编码一个双核酸酶H结构域,和绝大多数Ty3/Gypsy反转座元件类似不编码被膜蛋白。奥丁反转座元件代表了逆转录病毒和Ty3/Gypsy反转座元件间的进化“缺失环节”(missing link)。系统发生分析表明奥丁反转座元件和洛基逆转录病毒形成姐妹群,奥丁反转座元件和洛基逆转录病毒组成的单系群与逆转录病毒形成姐妹群,为研究逆转录病毒相关病毒的起源和进化提供了重要的进化框架。基于系统发生分析和基因组结构特征,该研究将洛基逆转录病毒和奥丁反转座元件分成两个新的病毒科——洛基逆转录类病毒科(Lokiorterviridae)和奥丁逆转录类病毒科(Odinorterviridae),将逆转录类病(bing)毒从(cong)目前的(de)6个科推广(guang)到了8个科。

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图1奥丁终结录类病毒码布置、基因遗传组结构特征和进一步
  • 更新时间
    2020年010月16日 16:31
  • 阅读量
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    生科院
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